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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
11/09/2020 |
Data da última atualização: |
18/12/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MALTZAHN, L. E.; VIANA, V. E.; BUSANELLO, C.; VENSKE, E.; GIRARDI, C. L.; OLIVEIRA, A. C. DE; PEGORARO, C. |
Afiliação: |
Latóia Eduarda Maltzahn, Laboratório de Genômica e Fitomelhoramento, Departamento de Fitotecnia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Capão do Leão, Brazil; Vívian Ebeling Viana, Laboratório de Genômica e Fitomelhoramento, Departamento de Fitotecnia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Capão do Leão, Brazil; Carlos Busanello, 1 Laboratório de Genômica e Fitomelhoramento, Departamento de Fitotecnia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Capão do Leão, Brazil; Eduardo Venske, 1 Laboratório de Genômica e Fitomelhoramento, Departamento de Fitotecnia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Capão do Leão, Brazil; CESAR LUIS GIRARDI, CNPUV; Antonio Costa de Oliveira, Laboratório de Genômica e Fitomelhoramento, Departamento de Fitotecnia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Capão do Leão, Brazil; Camila Pegoraro, Laboratório de Genômica e Fitomelhoramento, Departamento de Fitotecnia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Capão do Leão, Brazil. |
Título: |
ATG genes, new playerson early Fe toxicity response in rice (Oryza sativa). |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Breeding, p. 1-13, July 2020. |
DOI: |
10.1111/pbr.12860 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Rice yield is frequently impaired by abiotic adverse conditions in several parts of the globe. One of these constraints is soil iron toxicity. Plants respond to adverse conditions by activating different mechanisms, some of which have already been elucidated. Recently, autophagy has been associated with plant tolerance to abiotic stresses, however, the involvement of this mechanism in the response to iron toxicity has never been studied. Autophagy is a process of recycling cellular components and involves approximately 30 genes in rice. Thus, the objective of this study was to characterise the regulation and transcriptional activation of OsATG genes in rice seedlings under iron toxicity. In this condition, OsATG genes were induced in the tolerant genotype and repressed in the sensitive one. Also, OsATG gene promoters are rich in W-box cis-regulatory elements targeted by WRKY transcription factors. These results suggest that OsATG genes are involved in early iron toxicity response and the regulation of these genes can occur via WRKY. This study provides early insights into the involvement of autophagy in iron toxicity response. KEYWORDS abiotic stress, autophagy, gene expression, genotyping, iron, transcriptional regulation |
Palavras-Chave: |
Transcriptional regulation. |
Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Autophagy; Gene expression; Genotyping; Iron. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
Marc: |
LEADER 02001naa a2200277 a 4500 001 2124879 005 2020-12-18 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1111/pbr.12860$2DOI 100 1 $aMALTZAHN, L. E. 245 $aATG genes, new playerson early Fe toxicity response in rice (Oryza sativa).$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aRice yield is frequently impaired by abiotic adverse conditions in several parts of the globe. One of these constraints is soil iron toxicity. Plants respond to adverse conditions by activating different mechanisms, some of which have already been elucidated. Recently, autophagy has been associated with plant tolerance to abiotic stresses, however, the involvement of this mechanism in the response to iron toxicity has never been studied. Autophagy is a process of recycling cellular components and involves approximately 30 genes in rice. Thus, the objective of this study was to characterise the regulation and transcriptional activation of OsATG genes in rice seedlings under iron toxicity. In this condition, OsATG genes were induced in the tolerant genotype and repressed in the sensitive one. Also, OsATG gene promoters are rich in W-box cis-regulatory elements targeted by WRKY transcription factors. These results suggest that OsATG genes are involved in early iron toxicity response and the regulation of these genes can occur via WRKY. This study provides early insights into the involvement of autophagy in iron toxicity response. KEYWORDS abiotic stress, autophagy, gene expression, genotyping, iron, transcriptional regulation 650 $aAbiotic stress 650 $aAutophagy 650 $aGene expression 650 $aGenotyping 650 $aIron 653 $aTranscriptional regulation 700 1 $aVIANA, V. E. 700 1 $aBUSANELLO, C. 700 1 $aVENSKE, E. 700 1 $aGIRARDI, C. L. 700 1 $aOLIVEIRA, A. C. DE 700 1 $aPEGORARO, C. 773 $tPlant Breeding, p. 1-13, July 2020.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
27/07/2015 |
Data da última atualização: |
14/02/2018 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SOUZA, R. C.; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; GOMES, R. R.; VICENTE, V. A.; HUNGRIA, M. |
Afiliação: |
UFPR; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; MARCO ANTONIO NOGUEIRA, CNPSO; LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica; UTPR; UFPR; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
Título: |
Triagem de hidrolases por metagenômica de solos agrícolas do Norte do Paraná. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO NACIONAL DE MICROBIOLOGIA AMBIENTAL, 14., João Pessoa, 2014. Anais... |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Hidrolases englobam um grupo de enzimas que catalisam a quebra de ligações covalentes em reação com água; entre elas estão as proteases, amilases, lipases, pectinases, celulases e catalases. Essas enzimas são muito importantes, com ampla utilização na indústria em geral. O solo é um ambiente muito rico e diverso em microrganismos, sendo considerado a maior fonte para obtenção de substâncias, enzimas e antibióticos, por exemplo. Com a metagenômica, passou a ser possível acessar melhor esse potencial microbiano, permitindo a descoberta de novos genes e biomoléculas. Neste estudo foram coletadas amostras de solos (0-10 cm de profundidade) do norte do Paraná visando buscar hidrolases microbianas funcionais. Foi realizada a extração do DNA de um Latossolo Vermelho Eutroférrico sob quatro manejos de solo e de culturas distintos e as amostras foram submetidas ao sequenciamento utilizando a plataforma 454 (Applied Science). As sequências de DNA foram comparadas com o banco de dados não redundante (NR) do NCBI (National Center for Biotechnology Information) e KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) para busca de similaridade com proteases, amilases, lipases, pectinases, celulases e catalases. A partir do DNA total foram realizadas reações de PCR (Polymerase Chain Reaction) com primers degenerados direcionados para a amplificação de pectinases, celulases e lacases e os produtos de PCR foram purificados com Purelink kit (Invitrogen®) e sequenciados (ABI 3500xL, Aplied Biosystems®). A comparação com as sequências do NCBI e KEGG resultou na identificação de 1.137 sequências com grande similaridade com a enzima lacase; 16.883 sequências para celulase; 2.001 para pectinase; 1.006 para amilase; e 3.725 para lipase. Esses resultados mostram que esses solos agrícolas representam uma fonte importante de recursos biológicos para aplicação industrial, principalmente de enzimas celulases. Até o presente momento, o sequenciamento de 26 produtos amplificados por PCR apresentou identidade para uma amostra, que foi identificada como a enzima celulase. MenosHidrolases englobam um grupo de enzimas que catalisam a quebra de ligações covalentes em reação com água; entre elas estão as proteases, amilases, lipases, pectinases, celulases e catalases. Essas enzimas são muito importantes, com ampla utilização na indústria em geral. O solo é um ambiente muito rico e diverso em microrganismos, sendo considerado a maior fonte para obtenção de substâncias, enzimas e antibióticos, por exemplo. Com a metagenômica, passou a ser possível acessar melhor esse potencial microbiano, permitindo a descoberta de novos genes e biomoléculas. Neste estudo foram coletadas amostras de solos (0-10 cm de profundidade) do norte do Paraná visando buscar hidrolases microbianas funcionais. Foi realizada a extração do DNA de um Latossolo Vermelho Eutroférrico sob quatro manejos de solo e de culturas distintos e as amostras foram submetidas ao sequenciamento utilizando a plataforma 454 (Applied Science). As sequências de DNA foram comparadas com o banco de dados não redundante (NR) do NCBI (National Center for Biotechnology Information) e KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) para busca de similaridade com proteases, amilases, lipases, pectinases, celulases e catalases. A partir do DNA total foram realizadas reações de PCR (Polymerase Chain Reaction) com primers degenerados direcionados para a amplificação de pectinases, celulases e lacases e os produtos de PCR foram purificados com Purelink kit (Invitrogen®) e sequenciados (ABI 3500xL, Aplied Biosystems... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Hidrolases. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/126993/1/Triagem-de-hidrolases-por-metagenomica-de-solos-agricolas-do-Norte-do-Parana.pdf
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Marc: |
LEADER 02720nam a2200193 a 4500 001 2020531 005 2018-02-14 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSOUZA, R. C. 245 $aTriagem de hidrolases por metagenômica de solos agrícolas do Norte do Paraná.$h[electronic resource] 260 $aIn: ENCONTRO NACIONAL DE MICROBIOLOGIA AMBIENTAL, 14., João Pessoa, 2014. Anais...$c2014 520 $aHidrolases englobam um grupo de enzimas que catalisam a quebra de ligações covalentes em reação com água; entre elas estão as proteases, amilases, lipases, pectinases, celulases e catalases. Essas enzimas são muito importantes, com ampla utilização na indústria em geral. O solo é um ambiente muito rico e diverso em microrganismos, sendo considerado a maior fonte para obtenção de substâncias, enzimas e antibióticos, por exemplo. Com a metagenômica, passou a ser possível acessar melhor esse potencial microbiano, permitindo a descoberta de novos genes e biomoléculas. Neste estudo foram coletadas amostras de solos (0-10 cm de profundidade) do norte do Paraná visando buscar hidrolases microbianas funcionais. Foi realizada a extração do DNA de um Latossolo Vermelho Eutroférrico sob quatro manejos de solo e de culturas distintos e as amostras foram submetidas ao sequenciamento utilizando a plataforma 454 (Applied Science). As sequências de DNA foram comparadas com o banco de dados não redundante (NR) do NCBI (National Center for Biotechnology Information) e KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) para busca de similaridade com proteases, amilases, lipases, pectinases, celulases e catalases. A partir do DNA total foram realizadas reações de PCR (Polymerase Chain Reaction) com primers degenerados direcionados para a amplificação de pectinases, celulases e lacases e os produtos de PCR foram purificados com Purelink kit (Invitrogen®) e sequenciados (ABI 3500xL, Aplied Biosystems®). A comparação com as sequências do NCBI e KEGG resultou na identificação de 1.137 sequências com grande similaridade com a enzima lacase; 16.883 sequências para celulase; 2.001 para pectinase; 1.006 para amilase; e 3.725 para lipase. Esses resultados mostram que esses solos agrícolas representam uma fonte importante de recursos biológicos para aplicação industrial, principalmente de enzimas celulases. Até o presente momento, o sequenciamento de 26 produtos amplificados por PCR apresentou identidade para uma amostra, que foi identificada como a enzima celulase. 653 $aHidrolases 700 1 $aCANTÃO, M. E. 700 1 $aNOGUEIRA, M. A. 700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R. 700 1 $aGOMES, R. R. 700 1 $aVICENTE, V. A. 700 1 $aHUNGRIA, M.
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Embrapa Soja (CNPSO) |
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